Автоматизированная система фенотипирования для изучения роста, состояния и реакции растений на внешние факторы

Автоматизированная система фенотипирования для изучения роста, состояния
и реакции растений
на внешние факторы

Фенотипирование растений в условиях теплицы — это точная фиксация того,
как развивается каждый образец:
как меняется высота, форма кроны, площадь листьев, цвет, биомасса
и реакция на стресс или болезни.

Традиционно такие наблюдения требуют большого объёма ручной работы: растения нужно перемещать, фотографировать, маркировать, сравнивать и вручную заносить данные. При большом количестве образцов это становится трудоёмким, медленным
и уязвимым к ошибкам.

Фенотипирование растений в условиях теплицы — это точная фиксация того, как развивается каждый образец: как меняется высота, форма кроны, площадь листьев, цвет, биомасса и реакция на стресс или болезни.

Традиционно такие наблюдения требуют большого объёма ручной работы: растения нужно перемещать, фотографировать, маркировать, сравнивать
и вручную заносить данные. При большом количестве образцов это становится трудоёмким, медленным и уязвимым к ошибкам.

Тепличная высокопроизводительная платформа решает эту задачу иначе. Она превращает процесс фенотипирования в автоматизированный цикл: растение само, без ручного переноса, доставляется из зоны выращивания в камеру съёмки, проходит анализ и возвращается обратно на своё место.

Тепличная высокопроизводительная платформа решает эту задачу иначе. Она превращает процесс фенотипирования
в автоматизированный цикл: растение само, без ручного переноса, доставляется из зоны выращивания в камеру съёмки, проходит анализ и возвращается обратно на своё место.

В основе работы системы — принцип «растение — сенсор — анализ»: образец перемещается к измерительному модулю, проходит визуализацию, а затем программные алгоритмы рассчитывают необходимые параметры. В брошюре платформа описана как система, объединяющая сбор изображений фенотипов растений и анализ параметров в условиях средних и крупных теплиц.
Для перемещения растений используется конвейерная система, которая доставляет образцы в затемнённую камеру для съёмки и анализа.

Работа камеры системы фенотипирования

В основе работы системы — принцип «растение — сенсор — анализ»: образец перемещается к измерительному модулю, проходит визуализацию, а затем программные алгоритмы рассчитывают необходимые параметры. В брошюре платформа описана как система, объединяющая сбор изображений фенотипов растений и анализ параметров в условиях средних и крупных теплиц.
Для перемещения растений используется конвейерная система, которая доставляет образцы в затемнённую камеру для съёмки и анализа.

Работа камеры системы фенотипирования

Из чего состоит система

Из чего состоит система

Платформа объединяет несколько функциональных узлов, которые работают как единый автоматизированный комплекс.

Платформа объединяет несколько функциональных узлов, которые работают как единый автоматизированный комплекс.

1. Зона размещения растений

Растения находятся в отдельных горшках на индивидуальных синих платформах. Площадки расположены по сетке, чтобы робот мог подъехать
к нужному образцу, забрать его и затем вернуть на то же место.

Такое размещение важно для исследований, где необходимо регулярно наблюдать за большим количеством растений: сортами, линиями, экспериментальными группами, образцами с разными условиями выращивания или стрессовыми воздействиями.

 

Зона размещения растений

1. Зона размещения растений

Зона размещения растений

Растения находятся в отдельных горшках на индивидуальных синих платформах. Площадки расположены по сетке, чтобы робот мог подъехать к нужному образцу, забрать его и затем вернуть на то же место.

Такое размещение важно для исследований, где необходимо регулярно наблюдать за большим количеством растений: сортами, линиями, экспериментальными группами, образцами с разными условиями выращивания или стрессовыми воздействиями.

2. Мобильный робот

Зона размещения растений
Мобильный робот

2. Мобильный робот

Робот перемещается между рядами растений и выполняет функцию автоматического транспортного модуля. Он подъезжает
к выбранной платформе, заезжает под неё, поднимает растение
и доставляет его к началу конвейерной линии.

За счёт этого оператору не нужно вручную переносить горшки, контролировать очередность образцов и возвращать их на место после измерений.

Мобильный робот

Робот перемещается между рядами растений и выполняет функцию автоматического транспортного модуля. Он подъезжает к выбранной платформе, заезжает под неё, поднимает растение
и доставляет его к началу конвейерной линии.

За счёт этого оператору не нужно вручную переносить горшки, контролировать очередность образцов
и возвращать их на место после измерений.

3. Конвейерная линия

Конвейерная линия системы фенотипирования
Конвейер принимает платформу
с растением от робота и перемещает её
в камеру визуализации. По кадрам видно, что конвейер начинается на уровне,
к которому робот может подъехать вплотную, чтобы передать растение
на роликовую секцию.

3. Конвейерная линия

Конвейерная линия системы фенотипирования

Конвейер принимает платформу с растением от робота и перемещает её в камеру визуализации. По кадрам видно, что конвейер начинается на уровне,
к которому робот может подъехать вплотную, чтобы передать растение на роликовую секцию.

4. Камера съёмки и анализа

Растение заезжает внутрь камеры по конвейеру. После этого двери закрываются, чтобы создать контролируемые условия съёмки: без влияния внешнего света, случайных бликов и изменений освещения в теплице.

Внутри камеры расположены сенсорные и световые модули. В зависимости
от конфигурации система может включать видимую 2D-визуализацию, видимую 3D-визуализацию и гиперспектральный модуль.

Камера съёмки и анализа системы фенотипирования

4. Камера съёмки и анализа

Камера съёмки и анализа системы фенотипирования

Растение заезжает внутрь камеры
по конвейеру. После этого двери закрываются, чтобы создать контролируемые условия съёмки:
без влияния внешнего света, случайных бликов и изменений освещения в теплице.

Внутри камеры расположены сенсорные и световые модули. В зависимости

от конфигурации система может включать видимую 2D-визуализацию, видимую 3D-визуализацию и гиперспектральный модуль.

5. Программный модуль анализа данных

Программный модуль анализа данных системы фенотипирования

После съёмки система автоматически обрабатывает полученные изображения и рассчитывает параметры растения. Данные связываются
с конкретным образцом, что особенно важно при длительных экспериментах, повторных измерениях и сравнении групп.

Программный модуль анализа данных системы фенотипирования

5. Программный модуль анализа данных

После съёмки система автоматически обрабатывает полученные изображения и рассчитывает параметры растения. Данные связываются
с конкретным образцом, что особенно важно при длительных экспериментах, повторных измерениях и сравнении групп.

Как проходит цикл работы

Цикл работы тепличной системы фенотипирования

Как проходит цикл работы

Цикл работы тепличной системы фенотипирования

Какие данные даёт фенотипирование растений
с помощью платформы

Система позволяет оценивать растение
не только визуально, но и количественно.
В зависимости от комплектации платформа может работать с разными типами визуализации.

Какие данные даёт фенотипирование растений с помощью платформы

Система позволяет оценивать растение не только визуально, но и количественно. В зависимости от комплектации платформа может работать с разными типами визуализации.

2D-визуализация

2D-визуализация

Модуль видимой 2D-визуализации используется для анализа базовой морфологии растения. Он позволяет оценивать площадь контура, площадь выпуклой оболочки, высоту и ширину кроны, степень заворачивания листьев, количество вершин листьев, степень сохранения зелени, признаки старения, цвет, текстуру, объём и биомассу.
Эти параметры указаны в сравнении конфигураций для блока видимой 2D-визуализации.
2D-визуализация растения

Такой модуль подходит для сравнения сортов, скрининга мутантов, оценки роста и анализа реакции растений на условия окружающей среды.

Модуль видимой 2D-визуализации используется для анализа базовой морфологии растения. Он позволяет оценивать площадь контура, площадь выпуклой оболочки, высоту и ширину кроны, степень заворачивания листьев, количество вершин листьев, степень сохранения зелени, признаки старения, цвет, текстуру, объём и биомассу. Эти параметры указаны в сравнении конфигураций для блока видимой 2D-визуализации.

Такой модуль подходит для сравнения сортов, скрининга мутантов, оценки роста и анализа реакции растений на условия окружающей среды.

2D-визуализация растения

3D-визуализация

3D-визуализация

3D-модуль позволяет строить трёхмерные модели растений и точнее оценивать пространственные параметры: высоту и ширину кроны, соотношение высоты кроны, объём, площадь поверхности и биомассу.

3D-визуализация растения

Это особенно важно, когда исследователю нужно понять не только размер растения, но и его структуру: форму кроны, плотность, развитие надземной части и изменение архитектуры растения во времени.

3D-модуль позволяет строить трёхмерные модели растений и точнее оценивать пространственные параметры: высоту и ширину кроны, соотношение высоты кроны, объём, площадь поверхности и биомассу.

Это особенно важно, когда исследователю нужно понять не только размер растения, но и его структуру: форму кроны, плотность, развитие надземной части и изменение архитектуры растения во времени.

3D-визуализация растения

Гиперспектральная визуализация

Гиперспектральная визуализация

Гиперспектральный модуль позволяет анализировать отражение света
от разных частей растения
и рассчитывать спектральные индексы.
В брошюре указаны NDVI, RVI, GVI,
а также параметры, связанные
с содержанием хлорофилла и азота
в кроне растения.

Гиперспектральная визуализация растения

Такие данные помогают оценивать физиологическое состояние растения: питательный статус, признаки стресса, различия между здоровыми
и поражёнными участками, а также изменения, которые могут быть незаметны при обычном визуальном осмотре.

Гиперспектральный модуль позволяет анализировать отражение света
от разных частей растения и рассчитывать спектральные индексы. В брошюре указаны NDVI, RVI, GVI, а также параметры, связанные с содержанием хлорофилла и азота в кроне растения.

Такие данные помогают оценивать физиологическое состояние растения: питательный статус, признаки стресса, различия между здоровыми
и поражёнными участками, а также изменения, которые могут быть незаметны при обычном визуальном осмотре.

Гиперспектральная визуализация растения

Для каких задач применяется система

Для каких задач применяется система

Платформа подходит для исследований, где нужно работать с большим количеством растений и регулярно получать объективные данные об их состоянии.

Платформа подходит для исследований, где нужно работать с большим количеством растений и регулярно получать объективные данные об их состоянии.

Генетическая селекция

Генетическая селекция

Система помогает сравнивать сорта, линии и мутантные формы по скорости роста, форме кроны, площади листьев, биомассе, цвету и реакции на стресс.

Физиология растений томата

Физиология растений

Платформа позволяет отслеживать развитие растения в динамике: изменение кроны, биомассы, окраски листьев и признаков старения или стресса.
Исследования стрессовых факторов

Исследования стрессовых факторов

Система применяется для оценки реакции растений на температуру, засоление, болезни, вредителей и другие стрессовые воздействия.

Патология и защита растений

Патология и защита растений

Визуальный и гиперспектральный анализ помогают выявлять поражённые участки, оценивать степень заболевания
и отслеживать изменения состояния растения.
Генетическая селекция

Генетическая селекция

Система помогает сравнивать сорта, линии
и мутантные формы по скорости роста, форме кроны, площади листьев, биомассе, цвету
и реакции на стресс.

Физиология растений томата

Физиология растений

Платформа позволяет отслеживать развитие растения в динамике: изменение кроны, биомассы, окраски листьев и признаков старения или стресса.

Исследования стрессовых факторов

Исследования стрессовых факторов

Система применяется для оценки реакции растений на температуру, засоление, болезни, вредителей и другие стрессовые воздействия.

Патология и защита растений

Патология и защита растений

Визуальный и гиперспектральный анализ помогают выявлять поражённые участки, оценивать степень заболевания и отслеживать изменения состояния растения.

Тепличная высокопроизводительная платформа для сбора и анализа фенотипов растений позволяет перевести фенотипирование из ручного процесса
в автоматизированный исследовательский цикл. Робот забирает растение с индивидуальной станции, передаёт его на конвейер, система проводит съёмку
в контролируемых условиях, анализирует морфологические, цветовые, текстурные и спектральные параметры, после чего растение возвращается на место.

Тепличная высокопроизводительная платформа для сбора и анализа фенотипов растений позволяет перевести фенотипирование из ручного процесса
в автоматизированный исследовательский цикл. Робот забирает растение
с индивидуальной станции, передаёт его на конвейер, система проводит съёмку
в контролируемых условиях, анализирует морфологические, цветовые, текстурные
и спектральные параметры, после чего растение возвращается на место.

Такой подход помогает исследователям быстрее получать данные, точнее сравнивать растения между собой, отслеживать динамику роста и выявлять признаки стресса, заболеваний или изменений питательного статуса. Платформа особенно актуальна для селекции, физиологии растений, молекулярной биологии, патологии растений, экологии и защиты растений — то есть для задач, где важны массовые измерения, воспроизводимость и объективная цифровая оценка состояния растений.

Такой подход помогает исследователям быстрее получать данные, точнее сравнивать растения между собой, отслеживать динамику роста и выявлять признаки стресса, заболеваний
или изменений питательного статуса. Платформа особенно актуальна для селекции, физиологии растений, молекулярной биологии, патологии растений, экологии и защиты растений — то есть для задач, где важны массовые измерения, воспроизводимость
и объективная цифровая оценка состояния растений.

Оборудование фенотипирования растений

Мобильность: четырехколесный независимый привод и рулевое управление
Время автономной работы: ≥ 6 часов (в среднем)
Точность: ±2 °C или ±2 %